根据《企业所得税法》规定，该丹麦公司在中国境内取得货运收入，应该缴纳企业所得税。但根据中丹税收协定和海运协定的规定，如果该丹麦公司是丹麦的居民企业，可以享受相关的免税待遇。目前关于执行税收协定程序的文件，即《国家税务总局关于印发〈非居民享受税收协定待遇管理办法（试行）〉的通知》（国税发〔2009〕124号），暂不包括国际运输企业。因此，这类问题仍按以前对海运企业减免税的管理程序规定办理。